官方提供的R语言安装教程:全面的 R 存档网络 (tsinghua.edu.cn)
在安装之前先使用命令更新软件列表,命令中的 – qq 参数用于减少命令执行时的输出信息。
# update indices
sudo apt update -qq
安装依赖项:dirmngr
(用于管理密钥)、gnupg
(用于加密通信和签名验证)、apt-transport-https
(允许apt
通过HTTPS协议访问资源)、ca-certificates
(CA证书,用于HTTPS连接)以及software-properties-common
(用于添加和管理软件源)
sudo apt install dirmngr gnupg apt-transport-https ca-certificates software-properties-common
安装software-properties-common
和dirmngr依赖包,通过使用 --no-install-recommends
选项可以不安装这两个包推荐的其他包。
# install two helper packages we need
sudo apt install --no-install-recommends software-properties-common dirmngr
使用wget
从R项目的云服务器下载Michael Rutter的公钥,并使用tee
命令将其追加到/etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc
文件中,使系统信任CRAN的Ubuntu仓库。
# add the signing key (by Michael Rutter) for these repos
# To verify key, run gpg --show-keys /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc
# Fingerprint: E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo tee -a /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc
使用add-apt-repository
将CRAN的Ubuntu仓库添加到系统的软件源列表中。$(lsb_release -cs)
是一个命令替换,它会被替换为当前Ubuntu发行版的代号(如focal
、groovy
或bionic
),以确保添加的软件源与当前系统兼容。
# add the R 4.0 repo from CRAN -- adjust 'focal' to 'groovy' or 'bionic' as needed
sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu $(lsb_release -cs)-cran40/"
输入命令安装R语言的基础包:
sudo apt install --no-install-recommends r-base
安装R语言构建包,安装后可以用于编译构建R包:
sudo apt install r-base-dev
在终端中输入一个大写的 R 来启动R语言交互模式
R
R语言交互模式启动成功
再查看下R包安装和导用有无异常,在交互模式中输入以下命令安装绘图用的R包ggplot2
install.packages("ggplot2")
接下来使用 library()函数 来导入R包 ,并在交互模式中输出一组变量
library(ggplot2)
# 定义并一个变量
a <- c(1, 2, 3)
print(a)
导包及输出变量正常
如果需要制作技术文档、数据分析、实验报告、工作报告等等,个人推荐使用R Markdown。
R Markdown是一种结合了R代码、文本和结果展示的动态文档工具,它使得用户能够创建可重复、可交互和可发布的报告、演示文稿、网页等多种文档类型,R Markdown文档的源文件扩展名为.Rmd。
在R Markdown文档中,用户可以直接嵌入R代码块,使用R语言进行数据处理、分析和可视化,代码块可以包含任何有效的R代码,并且可以在文档中的不同位置重复使用。
同时R Markdown支持多种输出格式,包括HTML、PDF、Word、Markdown等,它的编写方法和编写Markdown文档相似。
IDE推荐使用RStudio,画图与编写脚本都很方便。如果使用的VS Code可以下载以下插件:
R Debugger
插件安装后会在左侧任务栏生成图标
其中包括工作环境栏:
R包管理和帮助栏:
Markdown All in One(转换和预览markdown文档)
R Markdown All in One(转换和预览R Markdown文档)
在安装R Markdown之前先安装 Pandoc 用于处理Markdown文件格式
sudo apt install pandoc
在R鱼眼交互模式中输入命令安装rmarkdown包
install.packages("rmarkdown")
新建一个 test.rmd 文档,将以下内容复制进去
### hello world in R Markdown
```{r}
hello <- function(name) {
paste("Hello", name)
}
hello("world")
```
#### 生成一组随机数
```{r}
set.seed(1)
x <- rnorm(100)
```
#### 绘制直方图
```{r}
hist(x)
```
#### 绘制散点图
```{r}
y <- rnorm(100)
plot(x, y)
```
```{r fig.width=6, fig.height=4}
plot(x, y)
```
编写完成后按快捷键 Ctrl+Shift+K 即可编译R Markdown文档为HTML文件或Word文档等格式,点开编译好的文件(我这里是.HTML文件),其中内容如下: